Antenatal Dönemde Yapılan Fetal Ultrasonografide Merkezi Sinir Sistemi Anomalisi Saptanan Fetuslarda Genetik Etiyolojinin Moleküler Düzeyde Araştırılması
31. Yılında 11. Uluslararası Katılımlı Erciyes Tıp Tıbbi Genetik Kongresi, Edirne, Türkiye, 25 - 27 Haziran 2026, ss.62, (Özet Bildiri)
- Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
- Basıldığı Şehir: Edirne
- Basıldığı Ülke: Türkiye
- Sayfa Sayıları: ss.62
- Trakya Üniversitesi Adresli: Evet
Özet
Merkezi sinir sisteminin (MSS)'nin ilk trimesterda değerlendirilmesi, serebral yapıların gebelik sırasında önemli ölçüde gelişmesi ve sürekli olarak şekil ve biçim değiştirmesi nedeniyle zordur. Akrania, ekzensefali, anensefali, holoprozensefali, sefalosel ve spina bifida, 14 haftadan önce kolayca teşhis edilebilen önemli prevalansa, sınırlı terapötik çözümlere ve en kötü kısa ve uzun vadeli prognoza sahip büyük anormallikleri temsil eder. Çalışmamızda, antenatal dönemde fetal beynin ve beyinciğin USG ile saptanan anomalilerinde altta yatan olası genetik nedenlerin moleküler düzeyde araştırılması amaçlanmaktadır. Bu amaç doğrultusunda Trakya Üniversitesi Hastanesi, Perinatoloji BD. polikliniğine ve/veya servisine başvuran gebelerden, birinci ve ikinci trimester takiplerinde fetal USG’de Dandy-Walker malformasyonu, korpus kallozum agenezisi, hipoplazisi, serebellar hipoplazi, Galen veni anevrizması ve ventrikülomegali, intraventriküler bantlar, intraventriküler kist ve hiperekoik odaklar saptanarak girişimsel işlem yapılan (koryon villus biyopsisi veya amniyosentez) ve karyotip analizi, mikrodizin analizi sonuçları normal saptanan 18 hasta dahil edildi. Perinatoloji Bilim Dalında hastaların 16‘sına amniyosentez, 2’sine kordosentez işlemi yapılmıştır. Çalışmaya dahil edilen hastaların yaş ortalaması 30.35 yaş olarak hesaplandı. Çalışmamıza dahil edilen 18 hastada NGS yöntemi ile 82 gen, tek nükleotid varyantları, küçük delesyonlar ve insersiyonlar açısından Clinical Insight (QCI, Qiagen) biyoinformatik programı, IGV (Integrative Genomics Viewer, oad Institute and Regents of the University) genomik data görüntüleme programı, Franklin ve Varsome in-siliko tahmin araçları kullanılarak değerlendirildi. Yapılan bioinformatik analizler sonucunda hastalarda saptanan varyantlar ACMG-2015 yönergesine göre değerlendirilerek, dbSNP, ClinVar, ClinGen, HGMD, OMIM açık erişimli veritabanlarında fenotip-genotip korelasyonu açısından karşılaştırıldı. Yapılan bioinformatik analiz sonucunda bazı hastalarda birden fazla varyant olmak üzere 18 hastada toplam 29 varyant saptandı. Varyantların ACMG-2015 yönergesine göre dağılımı şu şekildeydi: Bir hastada patojenik varyant, altı hastada fetal USG bulguları ile ilişkili olabilecek klinik önemi belirsiz varyant (variant of uncertain (or unknown) significance, VUS), dokuz hastada tesadüfi klinik önemi belirsiz varyant saptanırken, iki hastada varyant saptanmadı. Tarafımızca özgün olarak tasarlanan 82 geni kapsayan hedefli panelin hasta grubumuzdaki tanı oranı (sadece patojenik olarak saptanan varyant dikkate alındığında ) % 6’dır. Antenatal görüntüleme bulguları ile ilişkili olabilecek VUS varyantlar da dikkate alındığında mevut panelin tanı oranı % 38-39’a ulaşmaktadır.
Anahtar Kelimeler: FetalDNA, Antenatal, Holoprozensefali, NGS, Fetal USG