Geç Dönemde Hastanede Gelişen Pnömoni Etkenlerinin Hızlı Moleküler Biyolojik Yöntemlerle Saptanması
Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, cilt.26, sa.1, ss.78-87, 2021 (ESCI, TRDizin)
- Yayın Türü: Makale / Tam Makale
- Cilt numarası: 26 Sayı: 1
- Basım Tarihi: 2021
- Doi Numarası: 10.5578/flora.20219907
- Dergi Adı: Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi
- Derginin Tarandığı İndeksler: Emerging Sources Citation Index (ESCI), TR DİZİN (ULAKBİM)
- Sayfa Sayıları: ss.78-87
- Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
- Trakya Üniversitesi Adresli: Evet
Özet
Giriş: Hastaneye yatışı takip eden beşinci günden sonra ortaya çıkan geç dönemde hastanede gelişen pnömonilere (HGP) genellikle çok ilaca dirençli bakteriler neden olmaktadır. Etkenlerin geç saptanması, uygun antibiyotiğin zamanında başlanamaması HGP prognozunu olumsuz olarak etkilemektedir. Son yıllarda infeksiyon etkeni mikroorganizmaların hızlı moleküler yöntemlerle kısa sürede izole edilmesi, tedavinin daha erken ve etkin olarak başlanmasını sağlamaktadır. Bu çalışmada, HGP’de etkenlerin hızlı moleküler yöntemlerle saptan-ması ve sonuçların konvansiyonel yöntemlerle karşılaştırılması amaçlanmıştır.Materyal ve Metod: Ocak 2014 ile Ocak 2016 tarihleri arasında göğüs hastalıkları ile anestezi ve reanimasyon yoğun bakım ünitelerinde izlenen ve 2005 yılında yayımlanan ATS-IDSA kriterlerine göre HGP tanısı alan altmış iki hasta çalışmaya alınmıştır. HGP tanısı düşü-nüldüğü anda hastalardan bronkoskopik (BAL, BASP) ve nonbronkoskopik (mini-BAL) yöntemlerle alt solunum yolu örnekleri alınmıştır. Alınan örnekler hem konvansiyonel yöntemler ve hem de hızlı moleküler yöntemlerle bakteriyolojik etkenler açısından incelenmiştir.Bulgular: Hastanede gelişen pnömoni tanısı alan altmış iki hasta (kırk iki erkek, yaş ortalaması 69.7 ± 15.6) alınmıştır. Hastaların %95.2’sinde ek hastalık olup, otuz üç hastaya invaziv mekanik ventilasyon (İMV), 28 hastaya İMV + non-invaziv mekanik ventilasyon (NİV) uygulanmıştır. Konvansiyonel yöntem ile altmış iki hastanın kırkında (%64.5) bakteriyel etken saptanırken, polimeraz zincir reaksiyon (PZR) ile altmış iki hastanın elli yedisinde (%91.9) bakteriyel etken izole edilmiştir. Etken saptanması açısından konvansiyonel yöntem ile PZR yönteminin birbiriyle uyumlu olduğu gözlenmiştir (kappa: 0.797). Ayrıca, PZR ile etken saptanma oranının anlamlı olarak yüksek olduğu görülmüştür (p= 0.0004). Her iki yöntem ile en sık Acinetobacter baumannii saptanmıştır. İzlemde altmış iki hastanın kırk beşinde (%72.6) mortalite izlenmiştir.Sonuç: Geç dönemde ortaya çıkan HGP etkenlerinin saptanmasında konvansiyonel yöntemler ile PZR arasında uyumun iyi olduğu ve PZR ile daha fazla hastada etken saptanabileceği bu çalışmada gösterilmiştir.
Introduction: Late-onset hospital-acquired pneumonia (HAP) developing after the fifth day following admission to the hospital is usually caused by multi-drug resistant bacteria. Late detection of the agents and failure in starting the appropriate antibiotic treatment timely negatively affect HAP prognosis. Isolating infectious microorganisms in a short time by fast molecular methods in the last years has ensured that treatment can be started earlier and more effectively, which is thought to affect prognosis positively. In this study, it was aimed to determine the factors in HAP with rapid molecular methods and to compare the results with conventional methods.Materials and Methods: A total of 62 patients diagnosed with HAP according to the criteria of ATS/IDSA published in 2005 and followed-up in the intensive care units of Anesthesia and Reanimation Department and Chest Disease Departments between January 2014 and January 2016 were included into the study. Lower respiratory tract samples were obtained from patients after HAP diagnosis with bronchoscopic (bronchoalveolar lavage (BAL), bronchoscopic aspiration (BASP) and non-bronchoscopic (mini-BAL) methods. The samples were examined in terms of bacteriological agents with conventional methods and fast molecular methods.Results: Sixty-two patients (42 males, mean age: 69.7 ± 15.6) diagnosed with hospital-acquired pneumonia were included. Ninety-five point two percent of the patients had a comorbid disease. Invasive mechanical ventilation (IMV) was applied to 33 patients and non-in-vasive mechanical ventilation (NIV) was applied to 28 patients. In a total of 62 patients conventional methods and polymerase chain reaction (PCR) were used to detected in 40 (64.5%) and in 57 (91.9%) patients, respectively. It was observed that the conventional method and the PCR method were compatible with each other in terms of detecting the agent (kappa: 0.797). Besides, PCR was found to have a significantly higher rate of agent detection (p= 0.0004). Acinetobacter baumannii was detected most frequently with both methods. In the follow-up, mortality was observed in 45 (72.6%) of the 62 patients.Conclusion: As a result, it was shown in this study that there is a good agreement between conventional methods and PCR in the detection of late-onset HAP agents and that agents can be detected by PCR in more patients.