Characterization of calpastatin gene in purebred and crossbred Turkish Grey steppe cattle

KÖK S., Atalay S., SAVAŞÇI M., EKEN H. S.

Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, cilt.19, sa.2, ss.203-206, 2013 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

  • Yayın Türü: Makale / Tam Makale
  • Cilt numarası: 19 Sayı: 2
  • Basım Tarihi: 2013
  • Doi Numarası: 10.9775/kvfd.2012.7470
  • Dergi Adı: Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi
  • Derginin Tarandığı İndeksler: Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED), Scopus, TR DİZİN (ULAKBİM)
  • Sayfa Sayıları: ss.203-206
  • Trakya Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Kalpastatin (CAST), memeli dokularında bulunan ve kalsiyuma bağımlı doğal bir proteaz olan μ-kalpain’in spesifik bir inhibitörüdür. Sığır CAST geni içindeki genetik varyantlar, polimeraz zincir reaksiyonu-restriksiyon parça uzunluk polimorfizmi (PCR-RFLP) metodu kullanılarak analiz edildi. Çalışmada hayvan materyali olarak, Boz ırk ve Boz ırk x İsviçre Esmer melezlerinden oluşan 132 boğa ve düve kullanıldı. Çalışılan hayvan örneklerinde CAST/RsaI polimorfizminin C ve G alleleri karakterize edildi. C allel frekansı, saf Türk Boz ırklara nazaran melez grup içinde önemli bulunmuştur (P<0.05). Hayvan örneklerinin tümünde, C allel frekansı ortalaması %56.1’dir. Genotipik frekanslar, CC, CG ve GG genotipleri için sırasıyla, safkan Türk Boz ırkta; 0.257, 0.499 ve 0.243 ve Türk Boz ırk x İsviçre Esmer melezi popülasyonda; 0.388, 0.470 ve 0.142 olarak tahmin edildi. Sonuç olarak, genotipik dağılımlar Türk Boz ırk sığırı saf ve melez örneklerinin her ikisinde de dengededir.
Calpastatin (CAST) is a specific inhibitor of calcium-dependent neutral protease &#956;-calpain found in mammalian tissues. The genetic variants in the bovine CAST gene were analysed by using the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. The animal material of the study consisted of 132 bulls and heifers in Turkish Grey steppe cattle and Turkish Grey steppe x Brown Swiss crossbreds. C and G alleles are characterized by CAST/RsaI polymorphism were detected in the sample of animals were studied. Allele frequency C was significantly frequent in the crossbred group compared to the pure Turkish Grey steppe animals (P<0.05). In the total samples of animals, the average allele frequency C was 56.1%. Genotypic frequencies were estimated as 0.257, 0.499 and 0.243 in the purebred Turkish Grey steppe, and 0.388, 0.470 and 0.142 in the Turkish Grey steppe x Brown Swiss crossbred population for genotypes CC, CG and GG, respectively. As a result, genotypic distributions were equilibrium in both pure and crossbred examples of Turkish Grey steppe cattle.