Klinik Açıdan Önemli Bazı Trichophyton Türlerinin Hızlı Tespiti için Multiplex Real-Time PCR Temelli Bir Yöntem Geliştirilmesi

---

Şen B. (Yürütücü), Korkmaz A. F.

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, BAP Doktora, 2018 - 2021

• Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
• Destek Programı: BAP Doktora
• Başlama Tarihi: Aralık 2018
• Bitiş Tarihi: Nisan 2021

Proje Özeti

Bu çalışmada, klinik açıdan önemli bazı Trichophyton (6 tür) cinsine ait olan standart dermatofit küf suşlarını kültüre alarak, saf kültürlerini elde ettikten sonra ITS, IGS-1, Beta-Tubulin, ATP6, TEF1-α, Kalmodulin, Aktin, RPB-1, RPB-2 genlerinin lokuslarını hedefleyen primer ve prob setleri tasarlanacaktır. Tasarım öncelikle ITS hedefli yapılacak, ITS hedefli tasarımlarla özgül sonuç elde edilememesi durumunda ikincil ve üçüncül hedeflere başvurulacaktır. Tür spesifik gen dizileri GenBank'ten elde edilecektir (www.ncbi.nlm.nih.gov). Elde edilen diziler clustalO yazılımı (www.ebi.ac.uk) ile hizalanacaktır. Primer ve prob tasarımında Primer 3 yazılımı (http://bioinfo.ut.ee/primer3-0.4.0/) kullanılacaktır.