Akademik Veri Yönetim Sistemi
Güven S. G., Budak M., Yağız R., Taş A. (Yürütücü)
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, BAP Araştırma Projesi, 2020 - 2023
ÖZET GİRİŞ-AMAÇ: Larinks kanserleri, solunum yolu ve ses telleri üzerinde ortaya çıkan tümörlerdir ve genellikle çeşitli genetik ve epigenetik faktörlerle ilişkilendirilirler. Bu çalışma, CpG metilasyon durumunun larinks kanserlerindeki rolünü inceledi. DCLK1, Shox2 ve Sult1A1 genlerindeki CpG metilasyon durumu hasta ve kontrol grupları arasında karşılaştırılmıştır. GEREÇ ve YÖNTEMLER: Örnek Toplama: Laringeal kanser hastalarından ve kontrol bireylerinden dokusal materyal örnekleri alınmıştır. Bu örnekler tıbbi biyopsi yöntemleriyle elde edilmiştir. DNA İzolasyonu: Elde edilen dokusal materyallerden, DNA izolasyonu için uygun kitler kullanılarak genomik DNA örnekleri hazırlanmıştır. Metilasyon Spesifik PCR (MSP) Analizi: CpG metilasyon durumunun belirlenmesi için metilasyon spesifik PCR (MSP) yöntemleri kullanılmıştır. Özellikle DCLK1, Shox2 ve Sult1A1 genlerine özgü CpG bölgeleri hedeflenmiştir. Bu yöntemler, metillenmiş ve metilsiz DNA bölgelerini belirlemek için özelleştirilmiş primerler kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Veri analizinde, MSP sonuçları, CpG metilasyon durumlarının hasta ve kontrol grupları arasında karşılaştırması için kullanılmıştır. Chi-kare testi ve Yates düzeltilmiş Chi-kare testi ile istatistiksel analizler gerçekleştirilmiştir. BULGULAR: DCLK1 Geni: DCLK1 geninin CpG metilasyon durumu ile ilgili bulgular, metile ve unmethile gruplar arasında belirgin bir fark olduğunu göstermektedir (Kikare İstatistiği: 6.2308, p < 0.05). Yates düzeltilmiş sonuçlar da benzer bir eğilimi göstermektedir (Yates Düzeltmeli KiT.C. TRAKYA ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJELERİ BİRİMİ SONUÇ RAPORU F-6 kare İstatistiği: 4.9671, p < 0.05). Shox2 Geni: Hasta Grup: Shox2 geninin CpG metilasyon durumu, hasta ve kontrol grupları arasında anlamlı bir farklılık göstermektedir (Ki-kare İstatistiği: 11.3345, p < 0.05). Yates düzeltilmiş sonuçlar da bu farklılığı doğrulamaktadır (Yates Düzeltmeli Ki-kare İstatistiği: 9.59, p < 0.05). Sult1A1 Geni: Hasta Grup: Sult1A1 geni CpG metilasyon durumu, hasta ve kontrol grupları arasında anlamlı bir fark göstermemektedir. SONUÇ: Bu sonuçlar, DCLK1 ve Shox2 genlerinin CpG metilasyon durumunun larinks kanserlerinde belirleyici bir rol oynayabileceğini düşündürmektedir. Ancak, Sult1A1 geninin bu kanser türü ile ilişkilendirilemediği görülmüştür. CpG metilasyon durumunun larinks kanserlerinin etyopatogenezinde önemli bir faktör olabileceği düşünülerek, bu genlerin daha fazla araştırılması ve potansiyel terapötik hedefler olarak göz önünde bulundurulması gerekebilir. Bu çalışmanın sonuçları, laringeal kanserlerin moleküler mekanizmalarının daha iyi anlaşılmasına katkı sağlayabilir ve gelecekteki araştırmalar ve tedavi yaklaşımları için bir temel oluşturabilir. Anahtar Kelimeler: Larinks kanseri, metilasyon, DCLK1, Shox2, Sult1A1